植物学实验教学中心始建于1952年；2009年获准为国家级“实验教学示范中心建设单位”；2012年通过验收，正式获准为国家级“植物学教学示范中心”。

中心包括1个数码互动实验室、6个教学实验室、5个植物科学研究室、1个植物标本室和1个切片室。设专职实验人员8名，实验中心主任1名，其中教授4人，高级实验师3人，实验师2人。拥有现代化实验仪器设备1724台（套），总价值达1339万元。实验用房面积1677m²。

中心承担着全校生态、农学、林学、土地资源管理类等18个本科专业、12个硕士点、4个博士点的实验教学任务。全年完成90个本科班级和40名左右博士硕士研究生的实验教学任务。

现存自制教学切片8000余张、自制实验教学用塑封彩色照片600余张、自制植物学与植物分类学实验教学挂图600余幅、自制植物解剖学教学录像带1套、自制实验录像1套、自制植物学教学录像带1套、自制教学用浸制标本200余种（瓶）、自制教学用整体—分体包埋标本400余张、自制实践教学植物标牌200余张。由英国皇家植物园注册的植物标本室是植物学实验教学中心的重要组成部分，是目前内蒙古自治区植物标本收集规模最大、管理水平一流、唯一的数字标本馆，馆藏8万余份、数字化7万余份植物标本，1300余种植物配有活体彩色图片。